El motor está colgado con un eje que pasa de parte a parte por dos silentblocs...
El silentblock izquierdo (subido desde la moto el que queda en el lado izquierdo, en el lado que está el embrague), cómo está?
Está bien o está como "explotado"?
Quita el protector del embrague (son 3 tornillos), y sólo es para que no te pilles un pie o un dedo con la moto encendida, no tiene otra función) y una vez quitado el protector vuelve a arrancar la moto y mira si no hace ruido.
Si el ruido sigue, para la moto y quita la correa. Con la correa quitada haz guirar el plato polea con la mano (es el plato gris grande que pasa la correa y está donde los pedales) a ver si está doblado o gira bien.
Haz lo mismo con todo el embrague, fíjate si gira bien o si está doblado.